Genómica y proteómica
GUÍA DOCENTE Curso 2019-20
Titulación: | Máster Universitario en Química y Biotecnología | 760M |
Asignatura: | Genómica y proteómica | 5124 |
Materia: | Genómica y Proteómica |
Módulo: | Biotecnología |
Modalidad de enseñanza de la titulación: | Presencial | Carácter: | Optativa |
Curso: | 1 | Créditos ECTS: | 3,00 | Duración: | Semestral (Segundo Semestre) |
Horas presenciales: | 30,00 | Horas estimadas de trabajo autónomo: | 45,00 |
Idiomas en que se imparte la asignatura: | Español |
Idiomas del material de lectura o audiovisual: | Inglés |
Departamentos responsables de la docencia
AGRICULTURA Y ALIMENTACIÓN | R101 |
Dirección: | C/ Madre de Dios, 53 | Código postal: | 26006 |
Localidad: | Logroño | Provincia: | La Rioja |
Teléfono: | 941299720 | Fax: | 941299721 | Correo electrónico: | dpto.agricultura@unirioja.es |
Profesorado previsto
Profesor: | Ruiz Larrea, María Fernanda | Responsable de la asignatura |
Teléfono: | 941299749 | Correo electrónico: | fernanda.ruiz@unirioja.es |
Despacho: | 2213 | Edificio: | CENTRO CIENTÍFICO TECNOLÓGICO | Tutorías: | Consultar |
Descripción de los contenidos
Los contenidos de la asignatura están relacionados con el conocimiento a nivel avanzado de las ciencias Genómica y Proteómica y los principales se indican a continuación:
- Organización y estructura del genoma
- Mapeo de genomas
- Secuenciación genómica clásica y de nueva generación
- Proyectos de secuenciación
- Caracterización de la variabilidad genética
- Metagenómica
- Citogenómica
- Proteómica. Estructura de proteínas. Predicción y Mutagénesis dirigida
- Genómica funcional transcriptómica
- Metabolómica
- Aplicaciones y casos prácticos
- Herramientas informáticas para análisis de datos
Requisitos previos de conocimientos y competencias para poder cursar con éxito la asignatura
Recomendados para poder superar la asignatura.
Conocimientos previos y competencias de Bioquímica general.
Asignaturas que proporcionan los conocimientos y competencias:
Contexto
Esta asignatura pertenece a la especialidad de Biotecnología. La Genómica y Proteómica son actualmente disciplinas de obligada impartición en un máster de Biotecnología ya que recogen los conocimientos y las técnicas imprescindibles para gestionar correctamente la información que día a día se genera sobre los organismos vivos y su funcionamiento integral.
Competencias
Competencias generales
CG1 - Capacidad de análisis y síntesis a nivel avanzado en el ámbito de la Química y la Biotecnología.
CG2 - Capacidad de llevar a cabo proyectos de I+D+i relacionados con las materias propias del Máster.
CG3 - Habilidad para dar un uso avanzado a las herramientas de búsqueda de información relevante en el ámbito de la Química y la Biotecnología.
CG4 - Habilidad para comunicarse oralmente a nivel avanzado sobre temas de la Química y la Biotecnología, usando la terminología y técnicas aceptadas por los profesionales del sector.
CG5 - Habilidad para formular por escrito a nivel avanzado temas de la Química y de la Biotecnología usando correctamente diferentes tipos de enfoques académicos relacionados con su campo de estudio.
CG6 - Capacidad de iniciativa y autonomía para las distintas tareas propias de la actividad investigadora en el ámbito de las materias propias del Máster
Competencias específicas
CE10: Adquirir y aplicar en diferentes campos conceptos avanzados y de nuevas tecnologías para el análisis de los genomas de organismos procariotas y eucariotas así como para el estudio y el análisis de la expresión global de proteínas.
Resultados del aprendizaje
El alumno deberá:
- Conocer la organización del genoma en organismos procariotas y eucariotas
- Conocer las técnicas de secuenciación de nueva generación y otras técnicas avanzadas de Biología Molecular
- Conocer los fundamentos y aplicaciones de la variabilidad genética
- Conocer los fundamentos y aplicaciones de la mutagénesis dirigida
- Conocer los fundamentos y aplicaciones de la metagenómica
- Conocer los fundamentos y aplicaciones de la transcriptómica proteómica y metabolómica
- Conocer y saber aplicar las tecnologías relacionadas con la genómica y proteómica
Conocer las aplicaciones informáticas en genómica y proteómica
Temario
- Bloque temático I: Introduccióon a la Genómica
Bases y conceptos de la Genómica.
Organización y estructura del genoma en organismos procariotas y eucariotas.
- Bloque temático II: Genómica, Bioinformática y otras tecnologías "ómicas"
Secuenciación del DNA: métodos clásicos.
Estrategias de Secuenciación masiva aplicadas a Biomedicina.
Proceso de Secuenciación en Sistemas Illumina.
Análisis Bioinformático, Transcriptómica y Metagenómica.
- Bloque temático III: Proteómica
Bases y conceptos de la proteómica. Estructura de proteínas.
Investigación de la estructura primaria de las proteínas.
Investigación de la estructura tridimensional de las proteínas.
Interacciones entre proteínas. Mutagénesos dirigida.
Secuenciación y alineamiento de secuencias.
Búsqueda de mutaciones.
Métodos de extracción y purificación de proteínas.
Bibliografía
Tipo: | Título |
Básica | Título: Principles of genome analysis and genomics / Autores: Sandy B. Primrose, Richard M. Twyman.
Autor principal: Primrose, S. B.
Edición: 3rd ed.
Editorial: Malden (Massschusetts) : Blackwell, 2003
ISBN: 1-4051-0120-2; 978-1-4051-0120-2 Absys Biba |
Básica | Título: Principles of proteomics.
Autor: Twyman, Richard M.
Edición: 2nd ed.
Editorial: New York ; London : Garland Science, cop. 2014
ISBN: 978-0-8153-4472-8.
Absys Biba |
Básica | Título: Molecular biology and genomics [electronic resource].
Autor: Mülhardt, Cornel.
Editorial: Amsterdam ; Boston : Elsevier Academic Press, 2007.
ISBN: 9780120885466; 0120885468.
Absys Biba |
Básica | Título: Essentials of genomics and bioinformatics / edited by C. W. Sensen.
Editorial: Weinheim : Wiley-VCH, 2002.
ISBN: 3-527-30541-6.
Absys Biba |
Básica | Titulo: Next-Generation Genome Sequencing. Towards Personalized Medicine
Edited by Michael Janitz. Editorial: Wiley-VCH, 2008. ISBN:978-3-527-32090-5
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Recursos en Internet |
Titulo: Aprenda LINUX como si estuviera en primero
Autores: Iker Aginaga, Alberto Mora, Javier García de Jalón
Escuela Superior de Ingenieros Industriales de San Sebastian. 2000
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Metodología
Modalidades organizativas
Clases teóricas
Seminarios y talleres
Clases prácticas
Estudio y trabajo en grupo
Estudio y trabajo autónomo individual
Métodos de enseñanza
Método expositivo - Lección magistral
Estudio de casos
Resolución de ejercicios y problemas
Aprendizaje basado en problemas
Aprendizaje orientado a proyectos
Aprendizaje cooperativo
Organización
Actividades presenciales | Tamaño de grupo | Horas |
Clases teóricas | Grande | 15,00 |
Seminarios y talleres | Informática | 9,00 |
Clases prácticas | Laboratorio | 6,00 |
Total de horas presenciales | 30,00 |
Trabajo autónomo del estudiante | Horas |
Estudio autónomo individual o en grupo | - |
Preparación de trabajos, presentaciones (orales, debates, ...) | - |
Total de horas de trabajo autónomo | 45,00 |
Evaluación
Sistemas de evaluación | Recuperable | No Recup. |
Técnicas de observación | | 5% |
Trabajos y proyectos | 65% | |
Pruebas escritas | 25% | |
Pruebas de respuesta corta | | 5% |
Total | 100% |
Comentarios
Las pruebas de respuesta corta incluyen las actividades de evaluación continua mediante pruebas objetivas, y otros ejercicios realizados a través del aula virtual.
Para los estudiantes a tiempo parcial (reconocidos como tales por la Universidad), las actividades de evaluación no recuperable podrán ser sustituidas por otras, a especificar en cada caso. Esta posibilidad se habilitará siempre y cuando la causa que le impida la realización de la actividad de evaluación programada sea la que ha llevado al reconocimiento de la dedicación a tiempo parcial.
Criterios críticos para superar la asignatura
01/05/20 15:18:50 - G 2019-20 - 760M - 5124